本期美格导读为大家播报肠道微生物的最新研究进展.
TRENDSINMICROBIOLOGY
标题：InsightsintoendogenousBifidobacteriumspeciesinthehumangutmicrobiotaduringadulthood
译名：成年期人体肠道菌群内源性双歧杆菌的研究
作者：MurielDerrien等
时间：-05-13
期刊：TRENDSINMICROBIOLOGY
影响因子：18.23
摘要：双歧杆菌是许多哺乳动物中新生儿肠道中最早和最丰富的细菌定殖者之一，它们引发了所谓的宿主健康益处。虽然双歧杆菌物种的早期生命相关动态和多样性以及代谢和有益活动已经得到了很好的研究，但双歧杆菌对成人健康和福祉的功能贡献仍然较少。这篇评论文章讨论了目前关于与成年期相关的内源性双歧杆菌物种相关性的知识，确定了知识差距，并讨论了用合理选择的更适合成年宿主的双歧杆菌菌株来富集微生物群的机会。文章提出，该领域的当前知识和未来研究将有助于了解双歧杆菌在不同宿主年龄的肠道生态系统中发挥的生态，代谢和功能作用。
推荐语：这篇评论文章讨论了成虫中双歧杆菌的内源性群落，特别是那些作为流行物种存在的群落。研究考虑用双歧杆菌丰富成人肠道微生物群的机会，并讨论知识差距，以弥合未来的研究。文章中提出，基于生态学的对作为人类肠道微生物组一部分的双歧杆菌的多样性和功能的理解将为识别特定年龄类别的双歧杆菌菌株提供机会，以支持短期和长期人类健康。
Microbiome
标题：Gutmicrobiota-derivedursodeoxycholicacidfromneonataldairycalvesimprovesintestinalhomeostasisandcolitistoattenuateextended-spectrumβ-lactamase-producingenteroaggregativeEscherichiacoliinfection
译名：来自新生儿奶牛犊牛的肠道微生物群衍生的熊去氧胆酸改善肠道稳态和结肠炎，以减弱产生β内酰胺酶的肠聚集性大肠杆菌感染
作者：ZhiyuanHe等
时间：-05-28
期刊：Microbiome
影响因子：16.
摘要：抗菌药物通常用于预防和治疗年轻反刍动物肠道聚集性大肠杆菌（EAEC）引起的腹泻。然而，药物过度使用或滥用加速了产生多药耐药的广谱β内酰胺酶（ESBL）的传播。因此，需要补充食物作为抗生素的替代品，以防止新生儿奶牛犊牛大肠杆菌腹泻。熊去氧胆酸（UDCA）是一种治疗性胆汁酸，有助于缓解结肠炎。然而，UDCA如何帮助缓解ESBL-EAEC诱导的临床症状和结肠炎尚不清楚。该文对健康和腹泻新生儿犊牛的微生物谱和代谢物进行了研究，以确定早期生命发育中的微生物和代谢物生物标志物。研究对ESBL-EAEC感染的新生小鼠进行粪便微生物群移植。与对照组和安慰剂小鼠的微生物群相比，UDCA处理的新生小鼠的微生物群改善了结肠炎和后肠共生细菌损伤。研究表明，补充UDCA可减轻结肠炎并恢复结肠SCFA的产生。
推荐语：研究表明UDCA阻断了体外和体内细菌的生长和侵袭，缓解了通过TGR5-NF-κB轴感染脓毒症和结肠炎的新生儿小鼠模型中ESBL-EAEC感染期间的共生细菌生态失调，并上调了后肠消化液中的SCFA产生。研究结果提供了对UDCA介导的ESBL-EAEC感染缓解以及UDCA作为抗生素替代品的潜在作用的见解。
ScienceAdvances
标题：Innateimmunecellresponsetohost-parasiteinteractioninahumanintestinaltissuemicrophysiologicalsystem
译名：先天免疫细胞对人体肠道组织微生理系统中宿主-寄生虫相互作用的反应
作者：MouhitaHumayun等
时间：-05-06
期刊：ScienceAdvances
影响因子：14.
摘要：感染人类的原生动物寄生虫广泛存在，并导致各种临床表现，包括免疫功能低下个体中危及生命的疾病。动物模型提供了对寄生虫感染的先天免疫力的见解;然而，物种特异性差异和先天免疫反应的复杂性使得对人类的翻译具有挑战性。因此，需要能够阐明免疫控制和寄生虫传播机制的体外系统。该研究开发了一种肠道组织的人体微生理系统，用于评估感染过程中的寄生虫免疫特异性相互作用，该系统整合了原代肠道上皮细胞和免疫细胞，以研究原生动物寄生虫弓形虫上皮感染期间先天免疫细胞的作用，该寄生虫影响全球数十亿人。数据表明，寄生虫的上皮感染刺激中性粒细胞和自然杀伤细胞介导的细胞因子产生中广泛的效应子功能，这些细胞因子发挥免疫调节作用，证明了我们的系统在推进人与寄生虫相互作用研究方面的潜力。
推荐语：制定针对寄生虫感染的改进治疗策略需要增加对病原体-组织-免疫系统相互作用的了解。人类和小鼠之间的免疫系统组织存在差异，需要改进模型。因此，工具的开发使研究人员能够阐明涉及免疫反应和防御策略的机制，加速抗寄生虫药物的开发。在这方面，研究对人体肠道组织的MPS进行了生物工程改造，以探索人类先天免疫细胞对肠道中寄生虫感染的反应。
CellHostMicrobe
标题：Hostcellssubdividenutrientnichesintodiscretebiogeographicalmicrohabitatsforgutmicrobes
译名：宿主细胞将肠道微生物的营养生态位细分为离散的生物地理微栖息地
作者：MeganJ.Liou等
时间：-05-13
期刊：CellHostMicrobe
影响因子：31.
摘要：微生物群组成的变化与许多人类疾病有关，但控制菌株丰度的因素仍然定义不清。研究表明，共生大肠杆菌菌株和致病性肠道沙门氏菌血清型鼠伤寒分离株都利用硝酸盐进行肠道生长，但每种菌株都在不同的生物地理生态位中访问该资源。共生大肠杆菌利用上皮衍生的硝酸盐，而鼠伤寒沙门氏菌占据的生态位中的硝酸盐来自吞噬细胞浸润。令人惊讶的是，无毒的鼠伤寒沙门氏菌被证明不能利用上皮衍生的硝酸盐，因为它的趋化性受体McpB和McpC将病原体从大肠杆菌占据的生态位中排除。相反，大肠杆菌侵入由鼠伤寒沙门氏菌毒力因子构建的生态位，并通过竞争硝酸盐赋予定植抗性。因此，营养生态位不仅仅由关键资源定义，而是可以在宿主内进一步细分为不同的微生境，从而为不同的细菌物种产生新的生态位机会。
推荐语：微生物群组成的变化与许多人类疾病有关，因此对控制菌株移植和丰度的因素的分析与了解潜在的疾病过程相关。传统观点认为，肠道生态系统中的每个营养位都由关键资源定义，其丰度决定了其微生物摄取者的丰度。然而，该研究表明，由关键资源定义的营养生态位可以被宿主生物地理学进一步细分为不同的微生境，这一过程预测会增加存在的营养生态位的数量。
NatureCommunications
标题：Programmableprobioticsmodulateinflammationandgutmicrobiotaforinflammatoryboweldiseasetreatmentaftereffectiveoraldelivery
译名：可编程益生菌调节炎症和肠道菌群，用于有效口服后用于炎症性肠病治疗
作者：JunZhou等
时间：-06-14
期刊：NatureCommunications
影响因子：17.
摘要：活性氧(ROS)在肠道炎症中起重要作用。因此，通过过氧化氢酶、超氧化物歧化酶等抗氧化酶清除炎症部位的ROS可以有效抑制炎症性肠病(IBD)。本研究通过基因工程将一种口服益生菌大肠杆菌Nissle（ECN）改造为过表达过氧化氢酶和超氧化物歧化酶(ECN-pE)用于治疗肠道炎症。为了提高ECN-pE在胃肠道中的生物利用度，采用壳聚糖和海藻酸钠这两种有效的生物膜，通过逐层静电自组装策略包覆ECN-pE。在由不同化学药物诱导的小鼠IBD模型中，壳聚糖/海藻酸钠包被ECN-pE（ECN-pE（C/A）2）有效缓解炎症，修复结肠上皮屏障。出乎意料的是，这种工程化的EcN-pE（C/A）2还可以调节肠道微生物群落，提高肠道菌群中棘皮动物_NK4A和大通杆菌的丰度，这是维持肠道稳态的重要微生物。鉴于失调的肠道微生物群和肠道炎症与许多其他全身性疾病高度相关，益生菌的基因工程与功能性表面涂层一起可以为治疗许多其他疾病提供方便和有用的平台。
推荐语：该研究开发了一种工程益生菌，能够在胃肠道内原位产生CAT和SOD，并验证了其清除ROS的出色效率。研究结果表明，口服具有生物膜自包衣的基因工程益生菌可以有效地调节炎症和肠道微生物群，以缓解小鼠模型中的急性结肠炎。该研究为利用益生菌治疗肠道相关疾病的活性治疗性蛋白质的开发奠定了基础。
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